MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome linear

Total Repeats: 4208

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015508	CTTT	2	8	542313	542320	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_015508	GGA	2	6	542323	542328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_015508	GAA	2	6	542839	542844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_015508	TGCG	2	8	542922	542929	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1005	NC_015508	TCA	2	6	542941	542946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_015508	CAA	2	6	542956	542961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_015508	GCT	2	6	542986	542991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_015508	GACGT	2	10	543018	543027	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1009	NC_015508	CG	3	6	544445	544450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_015508	ACG	2	6	547509	547514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_015508	ATC	2	6	547542	547547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_015508	CAC	2	6	547640	547645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_015508	ATGA	2	8	547721	547728	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_015508	GCC	2	6	547787	547792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_015508	TCG	2	6	547803	547808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_015508	GGC	2	6	547839	547844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_015508	GACA	2	8	547846	547853	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_015508	CGCC	2	8	549266	549273	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1019	NC_015508	CGC	2	6	551982	551987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_015508	CTC	2	6	555047	555052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_015508	TTG	2	6	555057	555062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015508	CCT	2	6	555108	555113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1023	NC_015508	CTC	2	6	557717	557722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_015508	ATA	2	6	557766	557771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_015508	TTGT	2	8	558831	558838	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_015508	AT	3	6	558846	558851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_015508	CTC	2	6	560229	560234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_015508	ATT	2	6	560284	560289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_015508	CAT	2	6	560301	560306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_015508	T	6	6	560314	560319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_015508	T	6	6	565068	565073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_015508	CGG	2	6	565088	565093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_015508	CCAG	2	8	565156	565163	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_015508	TGAT	2	8	565179	565186	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_015508	CGC	2	6	565192	565197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_015508	TCC	2	6	565252	565257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_015508	C	6	6	565256	565261	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1038	NC_015508	CTC	2	6	569562	569567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_015508	TGA	2	6	569586	569591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_015508	AAC	2	6	570398	570403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_015508	CGA	2	6	570406	570411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_015508	GCG	2	6	570450	570455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_015508	GCC	2	6	570477	570482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_015508	GCC	2	6	570599	570604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_015508	GGA	2	6	570608	570613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_015508	GAG	2	6	572974	572979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_015508	ACG	2	6	575169	575174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_015508	GAA	2	6	575182	575187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_015508	AAT	2	6	575478	575483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015508	CAA	2	6	575514	575519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_015508	TAC	2	6	575524	575529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_015508	CAG	2	6	575786	575791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_015508	T	7	7	575838	575844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_015508	CTT	2	6	576700	576705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_015508	AGG	2	6	576800	576805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_015508	GCCT	2	8	577114	577121	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_015508	GCG	2	6	577122	577127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_015508	CG	3	6	577126	577131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_015508	CA	3	6	577146	577151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_015508	AGG	2	6	577175	577180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_015508	CAG	2	6	577476	577481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_015508	CTG	2	6	577482	577487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_015508	TGT	2	6	577502	577507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015508	GTT	2	6	577513	577518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_015508	T	6	6	577606	577611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_015508	CGC	2	6	577641	577646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_015508	GC	3	6	577692	577697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_015508	CCG	2	6	577738	577743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_015508	GC	4	8	577918	577925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_015508	GA	3	6	578263	578268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_015508	AAT	2	6	578629	578634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_015508	AT	3	6	578650	578655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015508	GTT	2	6	580223	580228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_015508	CGG	2	6	580229	580234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_015508	AAC	2	6	580237	580242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_015508	GCG	2	6	580503	580508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_015508	GTCCT	2	10	583700	583709	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1078	NC_015508	CCGG	2	8	583712	583719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_015508	GCGA	2	8	584057	584064	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1080	NC_015508	TCC	2	6	584095	584100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_015508	G	6	6	584107	584112	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_015508	AGG	2	6	584120	584125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_015508	CCTT	2	8	584802	584809	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_015508	CG	3	6	584886	584891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_015508	GCA	2	6	584925	584930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_015508	CCG	2	6	584949	584954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_015508	CGG	2	6	589730	589735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_015508	CGC	3	9	589772	589780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_015508	GCG	2	6	589785	589790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_015508	TTC	2	6	591079	591084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_015508	TCC	2	6	591085	591090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_015508	CTC	2	6	593998	594003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_015508	CGG	2	6	594071	594076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_015508	ATG	2	6	594081	594086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_015508	CGC	2	6	594098	594103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_015508	TCC	2	6	594112	594117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_015508	GC	3	6	594130	594135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_015508	CTT	2	6	595138	595143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_015508	TCC	3	9	596970	596978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_015508	GAC	2	6	596993	596998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_015508	TCC	3	9	598023	598031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_015508	AAC	2	6	598037	598042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_015508	GAT	2	6	598123	598128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_015508	ACTG	2	8	601136	601143	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_015508	CAA	2	6	601176	601181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_015508	TCA	2	6	601183	601188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_015508	ATG	2	6	601199	601204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_015508	TTG	2	6	602809	602814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_015508	ATA	2	6	602825	602830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_015508	GAT	2	6	602930	602935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_015508	T	6	6	603877	603882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_015508	GAG	2	6	604665	604670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_015508	GGCC	2	8	604999	605006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1114	NC_015508	CCG	2	6	606264	606269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_015508	GGCG	2	8	606278	606285	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_015508	AAT	2	6	606287	606292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_015508	GCT	2	6	606316	606321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_015508	GA	3	6	606322	606327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_015508	AAG	2	6	606328	606333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_015508	AGG	2	6	606353	606358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_015508	TCC	2	6	606369	606374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_015508	ACG	2	6	606521	606526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_015508	ATC	2	6	606547	606552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_015508	CGC	2	6	606575	606580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_015508	TC	3	6	609723	609728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_015508	GAC	2	6	611426	611431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_015508	GGCC	2	8	611485	611492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_015508	T	6	6	612788	612793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_015508	CGG	2	6	612829	612834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_015508	GAA	2	6	614679	614684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_015508	TC	3	6	614703	614708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_015508	CTG	2	6	618791	618796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_015508	GGCAA	2	10	618838	618847	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1134	NC_015508	CCT	2	6	618898	618903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1135	NC_015508	GGC	2	6	618910	618915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_015508	TCC	2	6	619917	619922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1137	NC_015508	GTT	2	6	619924	619929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_015508	TCC	2	6	622652	622657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1140	NC_015508	CG	3	6	625831	625836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1141	NC_015508	GA	3	6	625847	625852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_015508	GCG	2	6	625913	625918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1158	NC_015508	CGG	2	6	635578	635583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1159	NC_015508	CG	3	6	635672	635677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1160	NC_015508	CG	3	6	635689	635694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1266	NC_015508	GTCCT	2	10	665761	665770	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1267	NC_015508	CCA	2	6	665775	665780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1268	NC_015508	T	6	6	666444	666449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1269	NC_015508	ATG	2	6	666485	666490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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